Структура профессиональной подготовки представлена в ХГУ им. Н.Ф. Катанова 14 основными группами направлений подготовки высшего профессионального образования (физико-математические науки, естественные науки, гуманитарные науки, социальные науки, образование и педагогика, культура и искусство, экономика и управление, информационная безопасность, сфера обслуживания, сельское и рыбное хозяйство, информатика и вычислительная техника, технология продовольственных продуктов и потребительских товаров, строительство и архитектура, безопасность жизнедеятельности, природоустройство и защита окружающей среды), девятью основными группами среднего профессионального образования (гуманитарные и социальные науки, здравоохранение, культура и искусство, экономика и управление, сфера обслуживание, сельское и рыбное хозяйство, информатика и вычислительная техника, архитектура и строительство), программами послевузовского и дополнительного образования.
При создании ХГУ им. Н.Ф. Катанова за основу была принята многоуровневая модель профессиональной подготовки кадров, которая определила построение учебного процесса на принципе непрерывности и преемственности и создала условия для личностного выбора обучающимися индивидуальной образовательной траектории. В процессе развития университета принцип многопрофильности подготовки специалистов реализуется через программы высшего профессионального образования. Вошедшие в состав университета учреждения среднего профессионального образования продолжают подготовку кадров в областях образования, здравоохранения, культуры и искусства, сельского хозяйства и других по программам высшего профессионального образования.
